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  • 薛兴亚 徐 青 章飞芳 梁鑫淼;中药信息数据系统构建

  • 来源: 作者: 时间:2007-02-01 23:55:14
  • 核心提示:(中国科学院大连化学物理研究所 大连 116023) 中药是我国的传统用药。为人类健康已经发挥而且还将继续发挥巨大作用。随着我国加入WTO,国外医药公司纷纷争抢中国市场。如何应对挑战,利用我国在中药应用方面的优势,在
    (中国科学院大连化学物理研究所 大连 116023) 中药是我国的传统用药。为人类健康已经发挥而且还将继续发挥巨大作用。随着我国加入WTO,国外医药公司纷纷争抢中国市场。如何应对挑战,利用我国在中药应用方面的优势,在中医药理论的指导下,加速中医药现代化。研制“高效、安全、稳定、可靠”的现代中药成为我国药物研究与开发的重要方向。 组分中药的系统研究为中医药现代化开创了一条既基本符合中医理论、又与国际市场接轨的研究思路:从方剂、中成药、药材等原材料人手,发展高效高选择性分离材料。采用系统分离方法制备大量的中药标准组分。通过系统化学表征和系统生物学表征剖析其化学物质基础和作用原理,筛选功能组分,开发现代中成药、现代中药和组分中药。 组分中药的系统研究将产生海量的数据信息,包括方剂、中成药、药材等的基本信息,以及分离材料的合成信息.系统化学和生物学表征方法及表征数据。而且,组分中药的系统研究是一个长期过程,涉及的中药对象也逐渐积少成多,因此,研究过程中的数据积累甚为必要。目前,虽然已有一些中药方面的数据库,但由于缺乏系统设计,功能大多比较单一,尚不能完全满足组分中药的系统研究需要。 鉴于此,我们拟构建中药信息数据系统,收集和管理组分中药系统研究与开发过程中产生的大量数据信息,以化学计量学方法对中药化学和生物信息进行分析和表征,为制定药材和标准组分质量控制提供依据.为高效、深入研究中药药效物质基础、进行组分中药开发提供信息支撑平台。 一、总体设计 中药信息数据系统既包含丰富的自然信息和历史研究数据等基本信息。还包括化学及生物学表征等现代研究数据,以及对海量数据分别进行存储、管理和知识挖掘的中药信息数据库、中药信息数据管理系统和中药信息数据处理系统,通过对海量信息的收集与加工。最终形成有价值的新信息和新知识,基本的构建步骤如图1所示。 二、中药信息数据库 中药信息数据库是整个中药信息系统的基础,它是中药信息数据管理系统的主要操作对象,是中药信息数据处理系统的数据来源,是中药质量控制系统的评判依据,其结构如图2所示。中药信息数据库包括组分中药系统研究所涉及的各方面数据,如方剂、中成药、药材的基本信息,分离材料合成方法、系统分离方法、系统化学表征方法,以及相应的系统化学表征,如质谱、紫外(UV)、色谱、核磁、傅里叶红外(叮IR)光谱等现代信息,和系统生物学表征数据,也包括中药数据处理系统所产生的有价值数据,如黄酮、生物碱、……、有机酸等同系组分的色谱规律和质谱规律等。 中药信息数据库采用大型面向对象的关系数据库进行设计,其数据库关系如图3所示,按照组分中药的研究路线,依次创建由方剂、药材、中成药构成的基本信息库。分离材料方法库和系统分离方法库,标准组分库和功能组分库,包含分析方法库、化学表征库、生物学表征库、临床评价库的系列表征库,以及现代中成药库、现代中药库、组分中药库组成的产品库。 三、中药信息数据管理系统 中药信息数据管理系统主要承担中药信息数据库的数据维护任务。其功能如图4 所示。 1.完成信息数据的获取管理 确定信息数据的来源,并获取方剂、中成药、药材的基本信息,系统分离和系统化学表征等现代信息数据,以及分离材料合成方法、系统分离方法、系统化学表征方法等方法信息数据。 2.完成信息数据的质量管理 构建信息数据的质量标准,对基本信息数据、现代信息数据、方法信息数据的进行质量评价。 3.完成数据存储管理 选择适当的信息数据存储方式,设计方便、高效、准确的信息数据存储接口,实现基本信息数据、现代信息数据、方法信息数据的存储。 4.完成信息数据库維护与管理 实现信息数据库的数据备份、更新和系统维护功能。 5.完成信息数据处理系统维护与管理实现对信息数据的处理方法以及处理后所得到信息数据的管理和系统维护功能: 6.完成质量控制系统维护与管理 实现对质量控制系统的标准和方法管理和系统维护功能。 四、中药信息数据处理系统 中药信息数据处理系统在于对海量中药信息数据的深层次挖掘,为科学、准确地阐释组分中药的物质基础和作用原理提供强有力的分析工具,所设计该系统的六大功能示于图5。 1.完成色谱信息数据处理 实现色谱保留参数计算、保留值预测、重叠峰解析、峰形规律回归等数据处理,并采用相关结果进行色谱条件的仿真优化、结构与保留的相关性研究。 2。完成中药信息数据比较 实现色谱、质谱、核磁、红外、紫外等谱图的比较功能,为中药的指纹谱质量控制、未知成分的结构鉴定提供支持。 3.完成质谱数据处理 根据测定质谱数据,优化质谱分析条件,剖析已知成分的质谱裂解规律,预测可能结构的 中药同系成分的质谱裂解方式。 4.完成光谱信息数据处理 对氢谱、碳谱、红外和紫外光谱数据进行处理,从中提取特征表征数据。 5.完成化学/生物信息数据关联 将中药标准组分的组成或谱图信息与其生物活性数据进行关联,考察组分中药的药效物 质基础和生物作用原理。 6.完成多维数据处理 实现对二维高效液相色谱、二维毛细管电泳、二维超高效液相色谱/气相色谱、二维气相色谱数据的处理功能,包括体积积分、多维保留参数计算、多维峰形规律回归、多维操作条件优化等功能。 五、结 语 组分中药的系统研究将涉及大量关于方剂、中成药和药材的基本信息数据,并产生分离材料、系统分离、系统化学表征、系统生物学表征方面的海量现代信息数据。目前,中药数据库以药材或方剂的基本信息(包括中药化学结构信息)为主,也涌现出一些包含色谱及质谱等现代信息的数据库系统。但由于缺乏系统设计,功能大多比较单一,尚不能完全满足组分中药的系统研究需要。因此,针对性地设计了既包含丰富的自然信息和历史研究数据等基本信息、又包含化学及生物学表征等现代研究数据.以及对海量数据进行存储、管理和知识挖掘的中药信息数据系统,该系统包含中药信息数据库、中药信息数据管理系统和中药信息数据处理系统等部分.通过对海量信息的收集与加工,最终形成有价值的新信息和新知识。

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